La Oficina de Gestión Académica coordina la gestión de las titulaciones oficiales del IBEI. Se encarga de todos los procesos vinculados a la docencia (matrícula, expedientes, calendario académico, normativa académica, expedición de títulos oficiales y gestión de software para la docencia, organización de talleres y otras actividades académicas) y participa en la gestión del programa de prácticas. También se ocupa de la atención a los/las estudiantes y profesorado.

La Oficina de Admisiones se encarga de la promoción de programas de posgrado, la admisión de nuevos estudiantes, y la coordinación de las becas y ayudas. También coordina el programa de Movilidad Internacional.